載體指南
相關服務
載體構建質粒DNA制備
病毒包裝服務
mRNA基因遞送解決方案&nb科得sp;
CRISPR基因編輯解決方案
shRNA基因敲低解決方案
FLEX條件性表達慢病毒載體結合了載體家的高效的第三樹事代慢病毒載體系統和Cre響應的FLE匠我X條件性基因表達載體,幫助您實現在病毒宿主基因組上永久整合Cre重組酶響應的市有FLEX Cre-On基因調控開(kāi)關。有公FLEX Cre-On系統利用位于目的基因兩鐵嗎(liǎng)側的Lox-變體重組位點,在Cre重可銀組酶的調控下目的基因發(fā)生反樹什轉,目的基因正常表達;而Cre不存在的情況下,目的基因不表舞匠達。
FLEX Cre-On系統由兩(liǎn你自g)對(duì)異型Lox-變體重組位點組成(chéng),其中野生型序列稱看到爲LoxP,突變體稱爲Lox2272,分别位見車于反向(xiàng)基因ORF(相月理對(duì)啓動子方向(xiàng)而言)的兩(liǎn紙時g)側。 兩(liǎng)種(zhǒng)Lox-變體都(dōu)可被(bè坐媽i)Cre識别,但隻有相同的Lox位點錯讀對(duì)可以彼此重組,與其他Lox-變體不能(néng慢小)進(jìn)行重組。 LoxP和Lox2272位點以交替方式位于ORF兩票吃(liǎng)端,每對(duì)位點互爲反向(xiàng)。Cre重組酶不多著存在的情況時(shí),目的基因由于其編碼方向(xiàng)與啓動子方向(員火xiàng)相反,所以不發(fā)生表達;在Cre的存在下,朋工LoxP和Lox2272位點對(duì)分别重組,導緻ORF方向(xiàng頻南)反轉爲正向(xiàng),且其中的一對(duì)重服有組位點將(jiāng)具有相同的方向(xiàng新拍),Cre會(huì)介導産生正向(xiàng)重組切割,繼而分别留下一站在個不同的重組位點。 ORF的方向(xiàng)反轉,使得目的基因可如生以在啓動子的驅動下正常表達。由這喝于ORF側翼是兩(liǎng)個不同的Lox-變體位點,所以即使就吃存在Cre也不會(huì)進(jìn)一步發(fā)生重組。
慢病毒載體首先以質粒的方式構建信不并使用E. coli擴增,然後(hòu)與多個輔對道助質粒一同轉染至包裝細胞。載體上的兩(l爸低iǎng)個LTR區域之間的DNA序列將(jiāng)被(bèi)轉錄成(c藍了héng)RNA,而輔助質粒表理這達的病毒蛋白進(jìn)一步與這(zhè)些RNA組裝形成(ché影河ng)完整的病毒顆粒。有活性的病毒顆粒被事好(bèi)釋放到上清液中。病毒上生東清液可直接轉染或者濃縮後(hòu)轉染請技細胞。
當病毒感染靶細胞時(shí),唱從病毒RNA被(bèi)反轉錄成(chéng)DNA,然後(hòu)永久都用性整合到宿主基因組。位于兩(liǎng)個LTR區他拿域之間的FLEX Cre-On開(kāi)關連同其外呢他病毒基因組組分永久整合到宿主基因組。目的基因的激活表達可以在Cre重組酶的介年北導下通過(guò)反轉ORF編碼方向呢要(xiàng)實現。
通過(guò)改造優化,我們的慢病毒載體删除了與病毒包裝和轉導相關的基兵數因(這(zhè)些基因由輔助質粒進(jìn)行表達,用于病毒車請包裝過(guò)程),使産生的慢病毒顆粒是複制缺陷型的。即長不包裝的病毒隻具有轉導靶細胞的能(néng)力,而無法在靶細胞中進(jì又習n)行大量複制,因而具有很高的生物安全性。
關于該載體系統的更多信息,請參考以下文獻司廠。
參考文獻 | 主題 |
---|---|
J Virol. 72:8463 (1998) | The 3rd generation lentivirus vectors要好 |
Nat Protoc. 1:241 (2化你006) | Production and purificat鐵雜ion of lentiviral ve身資ctors |
Gene. 216:55 (1998) | Characterization of LoxP mutants, incl話說uding Lox2272 |
Nat Biotechnol. 21:562 (玩知2003) | Development of the FLEX swi山謝tch system |
J Neurosci. 28:7025 (街明2008) | Application of a F火人LEX switch system |
哺乳動物基因FLEX條件性表達慢病毒載體有村(Cre-On)專爲在哺乳動物細胞和動物體内實現高效火小的條件性基因激活表達而設計。目的基因剛開(kāi)始時(shí)爲默地離認不表達,但是在Cre重組酶共表達的情況下將(jiāng)被(bè校身i)激活表達,并且將(jiāng)反轉和改變目山我的基因的編碼方向(xiàng)。Cre存在的情況下,目的基因中森的表達受用戶自定義的啓動子的調控。
我們目前采用的是第三代慢病毒包裝載體系統。經(jīng)優化,該載體在大火我腸杆菌體内具有很高的拷貝數,包裝的活病毒具有很高的滴度,對(duì)大美快多數宿主細胞具有高效的轉導能(néng)力,能(né湖工ng)有效地把載體整合到靶細胞有機基因組并實現外源基因的高水平表達。
基因激活可控:目的基因ORF的反向(xiàng)放置,可防止基因發(fā)生洩來森漏表達。而某些條件性基因表達系統,如LoxP-Stop火章-LoxP表達載體系統,在某些情況下可能(裡從néng)會(huì)有一些低水平的漏表達。
基因穩定激活:在Cre的存在下,LoxP和Lox2272位點對(du城微ì)分别重組,導緻ORF方向(xiàng)票遠永久性地反轉爲正向(xiàng),且其中的一城件對(duì)重組位點將(jiāng)具有相同的方向(xiàng),Cre會(兵外huì)介導産生正向(xiàng)重組切割,繼而低物在ORF的兩(liǎng)端留下兩(liǎng)個不愛動同的Lox-變體,即使存在Cre也不會(huì)進(中冷jìn)一步發(fā)生重組,使得目的基因可以在客戶定制的啓動子驅動下正有火常表達。
外源基因的穩定整合:常規質粒轉染隻能(néng)實現外源基因的瞬時(shí)話如表達,這(zhè)種(zhǒng)外源基因會(huì)随著影睡(zhe)宿主細胞的分裂而不斷丢失,在媽銀快速分裂的細胞中顯得尤爲顯著。相反的是,慢病毒轉導的目的農門基因能(néng)穩定地整合到宿主細胞的染色體中 ,因而會自山(huì)随著(zhe)宿主細胞的分裂而穩定遺傳。
滴度高:我們的病毒載體可以包裝出高滴度的病毒。我們和水提供的病毒包裝服務,病毒滴度可開年以達到>109 TU/ml。在這(zhè)樣(yàng)的病毒滴度下,女靜如果選擇合适的劑量去轉導體外培養的哺乳動物細胞,則劇對轉導效率可接近100%。
宿主範圍廣泛:我們的病毒包裝系統包裝出來的病毒含有VS輛了V-G包膜蛋白,此蛋白擁有非常廣泛的親和性,可以轉導幾乎雨短所有的哺乳動物細胞,包括分裂細胞,非分裂細胞,原代細胞,穩定細友都胞系,幹細胞,分化細胞,貼壁細胞和懸浮細胞等各類哺乳動物細胞,甚至話子還(hái)可以轉導一些非哺乳動物細胞。使用傳統的轉為女染方式轉導神經(jīng)元細胞是非常難的,但是采用我們慢病但暗毒載體系統可以輕易的實現神經(jīng)元細胞的轉導。相對(duì)于場說在某些細胞中具有較低轉導效率的腺病毒和答我不能(néng)用于非分裂細胞的逆轉錄病毒而言,利用我們的慢病毒包裝系跳山統包裝出來的病毒具有廣泛的親和性。
基因拷貝數相對(duì)均一:通常情況下,采用病毒轉導的方式可以比男火較均一的將(jiāng)外源基因轉入靶細胞中,而傳統的質粒轉染則呈現出較高錯視的不均一性,導緻某些細胞會(huì)獲得較多拷貝質粒費也而某些則會(huì)獲得較少甚至完全沒(méi)有。
體内外實驗均有效:我們的載體不僅擁有良好(hǎo)的下訊體外細胞轉導能(néng)力,同樣(yàng)适用于體内活體動物實驗。
安全性高:我們的病毒載體系統具備了以下兩(liǎng)大特點,因而具風年有非常高的安全性。一、病毒包裝做拿和轉導所必需的基因由三個輔助質粒分開(kāi)表達。二、5'暗科 LTR的啓動子自失活。因此,在進(jìn)制金行病毒包裝和病毒轉導的時(shí)候不會(hu湖風ì)産生具有複制能(néng)力的病毒顆粒,使用我們購了的載體對(duì)人體的健康威脅也是最低的。
載體容量受限:野生型的慢病毒基因組大小約爲9.2 亮大kb,而在我們的慢病毒載體中,病毒包裝和轉導的必要元件約爲2.8 kb,餘下6兒國.4 kb的空間容納客戶的目的序列。當病人懂毒載體超過(guò)以上大小限制,制制病毒的包裝滴度將(jiāng)會(huì)大大降低。我舞南們的慢病毒載體除了可以插入靶基因的序列外,還(hái)可以插入啓動子和篩選标弟們記等載體元件。如果目的基因和這(zhè)些載體元件長(chán懂會g)度超過(guò)了6.4 kb,病毒的劇司産量有可能(néng)會(huì)明顯下降。
技術複雜:使用慢病毒載體時(shí),需要在包裝細胞中産生活草報病毒,然後(hòu)測定病毒滴度。因此慢病毒轉就女染相對(duì)于常規質粒轉染,技術難度更高,周期更長(ch喝頻áng)。
RSV promoter:&n信河bsp;Rous sarcoma virus promoter. 光謝It drives trans空懂cription of viral RNA in p說們ackaging cells. This RNA is then pack章照aged into live virus.
5' LTR-ΔU3: A deleted version of the HIV-1 5' lo船老ng terminal repeat.事術 In wildtype lentivir器妹us, 5' LTR and 3' LTR are 冷器essentially identical in sequence風我. They reside on two end電術s of the viral genome and point in th朋用e same direction. Upon vira票算l integration, the 3可車' LTR sequence is copied onto t年錢he 5' LTR. The LTRs carry bot商笑h promoter and polyadenyl離算ation function, such that in wildtype v放放irus, the 5' LTR acts as一要 a promoter to drive花區 the transcription 友家of the viral gen也中ome, while the 3' LTR acts as a p煙不olyadenylation signa市男l to terminate the ups吧和tream transcript. On our劇筆 vector, 5' LTR-Δ但些U3 is deleted for a r睡習egion that is required for the LTR's p人知romoter activity normally f民算acilitated by the viral transcription f微紅actor Tat. This does not affect the p資明roduction of viral RN麗說A during packaging becau短務se the promoter func下下tion is supplemented by the RSV pro技多moter engineered做民 upstream of 5'LTR-也飛ΔU3 LTR.
Ψ: HIV-1 packaging signal requi拍業red for the packaging of viral RN吧鄉A into virus.
RRE: HIV-1 Rev respo員光nse element. It allows t不務he nuclear export 照姐of viral RNA by the viral Rev pr長廠otein during vi又坐ral packaging.
cPPT: HIV-1 Central 頻民polypurine tract. It creates a "DNA個銀 flap" that increases nuclear import 匠員of the viral genome during target費請 cell infection. This improve人劇s vector integration into the離報 host genome, resu這體lting in higher transduction efficie讀弟ncy.
Promoter: The promoter driving海通 your gene of interest is placed here.計朋
Lox2272: Recombina關關tion site for Cre 動農recombinase. Mutated Lox site with two 懂很base substitutions of wild type LoxP秒說. Incompatible with LoxP sites章鐵. When Cre is present, th師器e LoxP and LoxP227低這2 sites will be cut and r是藍ecombine with compatible sites事為.
LoxP: Recombination site for C行制re recombinase. Incompat森冷ible with Lox2272 sites. When C東朋re is present, the LoxP and Lox22們訊72 sites will be cut理做 and recombine with com路分patible sites.
ORF: The open reading錯南 frame of your gene of inter裡筆est is placed here, in an ant去行isense orientation.
WPRE: Woodchuck hep跳黃atitis virus posttransc會呢riptional regulatory element. It enhan舞南ces transcriptional termination離村 in the 3' LTR during viral RNA 快花transcription, which leads to higher電書 levels of functional遠綠 viral RNA in packaging cells and h妹短ence greater viral titer. 計呢It also enhances transcriptional t請自ermination during th計唱e transcription of t睡電he user's gene of interest 下他on the vector, leading to their high藍理er expression levels.
CMV promoter: Human cytomegalovirus immed暗公iate early promoter. It drives the ubi懂影quitous expression of the downst在大ream marker gene.
Marker: A drug selection gene (s光東uch as neomycin resistance), a visual作愛ly detectable gene 費內(such as EGFP), or a dual道筆-reporter gene (such as EG聽都FP/Neo). This allows ce近制lls transduced with the v男報ector to be selected and/or visuali自雨zed.
3' LTR-ΔU3: A truncated version of吃算 the HIV-1 3' long ter要工minal repeat that deletes th聽吃e U3 region. This靜術 leads to the self-ina動器ctivation of the promoter activit男員y of the 5' LTR upon viral vector in資討tegration into the host genome 作國(since the 3' LT制男R is copied onto 5' LTR during viral i筆路ntegration). The polyadenylation 國人signal contained 內習in 3' LTR-ΔU3 serves to ter雪外minates all upstr頻笑eam transcripts produce喝化d both during viral pa和麗ckaging and afte下是r viral integration into the host geno我朋me.
SV40 early pA: Simian virus 40 early polyadenylation 路問signal. It furthe鐵可r facilitates transcri少視ptional termination after the 3' LTR船笑 during viral RNA transc線文ription during packagin房和g. This elevates the level of友說 functional viral RNA知海 in packaging cells, t窗電hus improving viral titer.
Ampicillin: Ampicillin resistance gene. It allo秒不ws the plasmid to be mainta科體ined by ampicillin selection in E. col錯訊i.
pUC ori: pUC origin of replication. Pla筆山smids carrying this origin exist in什路 high copy numbers 讀不in E. coli.
FLEX條件性表達慢病毒載體結合了載體家的高效的第三代慢病毒載拿木體系統和Cre響應的FLEX條件性基因表達載體,幫助您實現在病毒宿主基市喝因組上永久整合Cre重組酶響應的FLEX Cre-On基因信們調控開(kāi)關。FLEX Cre-On系統利筆會用位于目的基因兩(liǎng)側的Lox-變體重組位點,在Cre重組錯討酶的調控下目的基因發(fā)生反轉,目的基因正常表匠村達;而Cre不存在的情況下,目的基因不表達。
FLEX Cre-On系統由兩(liǎn視電g)對(duì)異型Lox-變體重組位點身好組成(chéng),其中野生型序列稱爲LoxP,突變體稱爲Lox2資歌272,分别位于反向(xiàng)基因黑坐ORF(相對(duì)啓動子方向(愛在xiàng)而言)的兩(liǎng)側。 兩(liǎng)種女熱(zhǒng)Lox-變體都(dōu)可被(b年在èi)Cre識别,但隻有相同的Lox位點對(哥低duì)可以彼此重組,與其他Lox-變體不能(nén如懂g)進(jìn)行重組。 LoxP和Lox2272窗匠位點以交替方式位于ORF兩(liǎng)端,每對(duì)位頻樂點互爲反向(xiàng)。Cre重玩些組酶不存在的情況時(shí),目的基因由于其編碼方向(xiàng)與鐵銀啓動子方向(xiàng)相反,所看湖以不發(fā)生表達;在Cre的存在下,LoxP和Lox2272位點愛歌對(duì)分别重組,導緻ORF方向(xiàn電黃g)反轉爲正向(xiàng),且其中的一對(duì)重組位點將(聽都jiāng)具有相同的方向(xiàng),Cre會(huì)介導産生正向(xi司女àng)重組切割,繼而分别留下一個不同的重組位點。 ORF的方向村亮(xiàng)反轉,使得目的基因可以在啓動子的驅動下正常表達。由于ORF側翼是喝北兩(liǎng)個不同的Lox-變體位點,所以即使存在Cre也不會(huì算雨)進(jìn)一步發(fā)生重組。裡體
慢病毒載體首先以質粒的方式構建并使用E. coli做黑擴增,然後(hòu)與多個輔助質粒一同轉染至包裝細胞。載體上的兩(liǎn對學g)個LTR區域之間的DNA序列將(jiān通短g)被(bèi)轉錄成(chéng)RNA,而嗎哥輔助質粒表達的病毒蛋白進(jìn)用嗎一步與這(zhè)些RNA組裝形成(喝近chéng)完整的病毒顆粒。有活性的病毒顆粒被(bèi)釋放到上清液中可銀。病毒上清液可直接轉染或者濃縮後(h熱是òu)轉染細胞。
當病毒感染靶細胞時(shí),病毒RNA被(bèi)反轉錄成(chén媽要g)DNA,然後(hòu)永久性整合到算開宿主基因組。位于兩(liǎng)個LTR區域之間的FLEX C請那re-On開(kāi)關連同其他病毒基因組組分永久整合到宿主基因組。目的基因店筆的激活表達可以在Cre重組酶的介導下通過(guò)反轉ORF編碼方向拍技(xiàng)實現。
通過(guò)改造優化,我們的科睡慢病毒載體删除了與病毒包裝和轉導相關的基因(這(關大zhè)些基因由輔助質粒進(jìn)行表達,用于病毒包裝過(頻和guò)程),使産生的慢病毒顆粒是複制缺陷型的。即包裝的病女算毒隻具有轉導靶細胞的能(néng)力,而無法在靶細胞中進(jìn)行大量複制行鐵,因而具有很高的生物安全性。
關于該載體系統的更多信息,請參考以下文獻。
參考文獻 | 主題 |
---|---|
J Virol. 72:8463 (1998) | The 3rd generation有美 lentivirus vectors |
Nat Protoc. 1:241 (2006) | Production and purificat老信ion of lentiviral vectors |
Gene. 216:55 (1998)場笑 | Characterization o大月f LoxP mutants, including L遠兵ox2272 |
Nat Biotechnol. 21:562 (2003) | Development of the FLEX switch system化器 |
J Neurosci. 28:7025 (2008) | Application of a FL樹你EX switch system |
哺乳動物基因FLEX條件性表達慢病毒載體(了慢Cre-On)專爲在哺乳動物細胞和動物體内實現高效著亮的條件性基因激活表達而設計。目的基因剛開(kāi)始時(shí)爲默認不表達月老,但是在Cre重組酶共表達的情況下將(jiāng)被(森算bèi)激活表達,并且將(jiāng)反轉和改變目的光林基因的編碼方向(xiàng)。Cre存在的情況下,目的基因的為信表達受用戶自定義的啓動子的調控。遠關
我們目前采用的是第三代慢病毒包裝載體系統。經(jīng熱森)優化,該載體在大腸杆菌體内具有很高花錢的拷貝數,包裝的活病毒具有很高的滴度,對(duì)大多數宿主細歌亮胞具有高效的轉導能(néng)力,能(néng)有效地把但外載體整合到靶細胞基因組并實現外源基因的高水平表達。
基因激活可控:目的基因ORF的反向(xiàng)放置,可防止基因購月發(fā)生洩漏表達。而某些條件性基因表達系統厭錢,如LoxP-Stop-LoxP表達載體系統,在某些情內你況下可能(néng)會(huì)有一些低水平的漏表達。
基因穩定激活:在Cre的存在下,LoxP和Lox2272位點對(duì)分别重組,導緻OR地銀F方向(xiàng)永久性地反轉爲正向(xiàng),且其中的一對(duì訊熱)重組位點將(jiāng)具有相同的方向地工(xiàng),Cre會(huì)介導一跳産生正向(xiàng)重組切割,繼而在ORF的議為兩(liǎng)端留下兩(liǎng)個不同鐘車的Lox-變體,即使存在Cre也不會(huì)進(jì制吃n)一步發(fā)生重組,使得目的基因可以在客戶場相定制的啓動子驅動下正常表達。
外源基因的穩定整合:常規質粒轉染隻能(néng)實現外源基因的瞬時(shí)表達,這吃術(zhè)種(zhǒng)外源基因會(huì)随著(zhe)宿主細胞的分裂而不城船斷丢失,在快速分裂的細胞中顯得尤爲顯著。相反的是,慢病毒微南轉導的目的基因能(néng)穩定地整合到宿主細胞的染色體中 ,因而會見金(huì)随著(zhe)宿主細胞的分裂而穩定遺傳南志。
滴度高:我們的病毒載體可以包裝出高滴度的病毒。我們提供的病土腦毒包裝服務,病毒滴度可以達到>109 TU/ml。在這(zhè)樣(yàng)的病毒滴度下,如果選擇醫能合适的劑量去轉導體外培養的哺乳動物細胞,則轉導效率可接近兵林100%。
宿主範圍廣泛:我們的病毒包裝系統包裝出來的病毒含有VSV-G包膜蛋白,此蛋白擁有非常廣泛的村請親和性,可以轉導幾乎所有的哺乳動話討物細胞,包括分裂細胞,非分裂細胞,原代細胞,穩定細胞系,工物幹細胞,分化細胞,貼壁細胞和懸浮細胞等各海站類哺乳動物細胞,甚至還(hái)可以轉導一些非哺乳動物細胞。使內劇用傳統的轉染方式轉導神經(jīng)元細胞是非常林作難的,但是采用我們慢病毒載體系統可以輕易的實現神經(jīng)元細胞的轉導。相跳還對(duì)于在某些細胞中具有較低轉導效率的腺病毒和不能窗坐(néng)用于非分裂細胞的逆轉錄病毒而言,利那志用我們的慢病毒包裝系統包裝出來的病毒具有美日廣泛的親和性。
基因拷貝數相對(duì)均一:通常情況下,采用病毒轉導的方式可以比較均一的將(jiāng)外源基大懂因轉入靶細胞中,而傳統的質粒轉染則呈現出較高的不均一性,導緻某些細習睡胞會(huì)獲得較多拷貝質粒而某些則會(huì)獲得較少甚至完全沒和雨(méi)有。
體内外實驗均有效:我們的載體不僅擁有良好(hǎo)很間的體外細胞轉導能(néng)力,同樣(yàng)适用于體内去明活體動物實驗。
安全性高:我們的病毒載體系統具備了以下兩(liǎng)大特點,因而具有非常高的安全性。一輛西、病毒包裝和轉導所必需的基因由三個輔助質粒分開(kāi)表達。二、5'日爸 LTR的啓動子自失活。因此,在進(jìn)行病毒湖線包裝和病毒轉導的時(shí)候不會(huì術問)産生具有複制能(néng)力的病毒顆粒,使用我們的載體對(duì)人舞光體的健康威脅也是最低的。
載體容量受限:野生型的慢病毒基因組大小約爲9.2 kb,而在我們的慢病毒載體中,病毒包煙西裝和轉導的必要元件約爲2.8 kb,餘下文笑6.4 kb的空間容納客戶的目的序列。當病毒載體超過(guò)以上大小限制,數懂病毒的包裝滴度將(jiāng)會(huì)間從大大降低。我們的慢病毒載體除了可以插入靶基因的序列外,還(h會票ái)可以插入啓動子和篩選标記等載體元件。如果目的坐器基因和這(zhè)些載體元件長(cháng)度超過(g月朋uò)了6.4 kb,病毒的産量有可能(néng)會(huì)明顯下風來降。
技術複雜:使用慢病毒載體時(shí),需要在包裝細胞中産生活病毒,然後(hò冷師u)測定病毒滴度。因此慢病毒轉染相對(duì)于常規質粒轉染,技術難度兵術更高,周期更長(cháng)。
RSV promoter: Rous sarcoma virus promoter. It drives海黑 transcription of vira中但l RNA in packagi一也ng cells. This R跳就NA is then packaged into live v費森irus.
5' LTR-ΔU3: A deleted version of the HIV-1 5' l姐行ong terminal repe視劇at. In wildtype lentivirus, 5' 購器LTR and 3' LTR are esse兵子ntially identical in s數遠equence. They reside on two ends of章民 the viral genome and point in 外醫the same direction. Upon v謝生iral integration, the 3' LTR s匠路equence is copied ont都影o the 5' LTR. The LTRs carry both 兵藍promoter and polyadenylation f門新unction, such that in wildtype民冷 virus, the 5' LTR在美 acts as a promoter to drive t麗友he transcription 多花of the viral genome,分理 while the 3' LTR acts紅兵 as a polyadenylati書能on signal to terminate the upstream那火 transcript. On 少從our vector, 5' LTR-ΔU3麗做 is deleted for a region 家費that is required for the LTR's promot鄉亮er activity normally facilitated by th林校e viral transcription factor T低科at. This does not aff民兒ect the production of viral RNA dur站志ing packaging because the pr能舞omoter function is supplemente頻信d by the RSV promoter engineered放子 upstream of 5'LTR-ΔU3 LTR.
Ψ: HIV-1 packaging signal req快聽uired for the packaging of viral RNA in有計to virus.
RRE: HIV-1 Rev respon藍作se element. It allows th學購e nuclear export of viral RNA你動 by the viral Rev protein du白店ring viral packaging.他地
cPPT: HIV-1 Centr國高al polypurine tract.就校 It creates a "DNA flap"媽制 that increases nuclear imp木愛ort of the viral genome durin看煙g target cell infection. This impro見窗ves vector integration into the ho票嗎st genome, result章東ing in higher transduction efficienc化東y.
Promoter: The promo服上ter driving your gene of interest秒但 is placed here.
Lox2272: Recombination site for Cre reco外雨mbinase. Mutated Lox你術 site with two base substitutio玩藍ns of wild type LoxP. Incompatible w西身ith LoxP sites. Wh笑司en Cre is present, the LoxP 頻務and LoxP2272 si機城tes will be cut and reco從樹mbine with compat明自ible sites.
LoxP: Recombination site fo雜湖r Cre recombinase. Incompatible wit吃海h Lox2272 sites. When Cre is pr技務esent, the LoxP 還人and Lox2272 sites will be cut我對 and recombine with compatible但的 sites.
ORF: The open reading frame of your鐵通 gene of interest is placed here, in 街場an antisense orientation.
WPRE: Woodchuck hepatitis virus po有不sttranscriptional regul唱厭atory element. It enhan高民ces transcriptional terminati下票on in the 3' LTR during viral R動相NA transcription, w我通hich leads to higher le厭月vels of functional viral RNA in 小劇packaging cells and西微 hence greater viral titer. It also enh服放ances transcriptio吧西nal termination during錯議 the transcriptio錢你n of the user's gene of i村志nterest on the vec術街tor, leading to their hi房做gher expression l用街evels.
CMV promoter: Human cytomegalovi為這rus immediate early promoter. It driv數也es the ubiquitous expression of 道術the downstream marker gene.
Marker: A drug selection gene (su務現ch as neomycin resistan吃站ce), a visually 費費detectable gene (such as EGFP), or a 物志dual-reporter gene (such as E店北GFP/Neo). This allows cells transd日為uced with the vector to be selected a機訊nd/or visualized.
3' LTR-ΔU3: A truncated version of the HIV紙東-1 3' long terminal 公鐵repeat that deletes the U3 region綠冷. This leads to 錢窗the self-inactivation of 信能the promoter act作著ivity of the 5' LTR upon viral vecto麗機r integration into下能 the host genom事事e (since the 3' LTR is劇器 copied onto 5' LTR du美就ring viral integration). The polyade市她nylation signal 讀聽contained in 3' LTR-ΔU3 serv照師es to terminates all upstream t暗煙ranscripts produced both during viral 輛可packaging and after viral integration 校道into the host genome.
SV40 early pA: Simian virus 40 earl會花y polyadenylation signal. It furthe商些r facilitates transcripti船頻onal termination after the 3' LTR dur也好ing viral RNA transcription during pa體麗ckaging. This elevates the level of學爸 functional viral R關睡NA in packaging cells, thus說男 improving viral tit司又er.
Ampicillin: Ampicillin resistance ge錢綠ne. It allows the plasmid to be現區 maintained by amp近內icillin selection in E. coli.
pUC ori: pUC origin of replication. Pla藍看smids carrying this origin木我 exist in high copy n近爸umbers in E. coli.