爲什麼(me)我的熒光蛋白這(zhè)弟電麼(me)弱?

低到中等程度的抗性基因表達就(jiù)能銀間(néng)讓細胞獲得對(duì)什們藥物的抗性。相反,熒光蛋白(FP)則需要高水平的表達才能(néng)獲得明亮的店高熒光信号,較低或者中等程度的熒光表達會(huì)産生較弱說北的熒光信号,甚至會(huì)低于設備檢測的最低臨界值。此外,某些熒光蛋白(車黑如EBFP)比常用熒光蛋白(如EGFP)更暗淡,特别難以檢測。一些研究人員不得我視不使用抗熒光蛋白抗體,以可視化體外細胞培養或體内的熒光蛋白。以下是導緻熒道從光不良的最常見原因:

弱啓動子驅動熒光蛋白的表達

有一些啓動子本身就(jiù)比較弱(如UBC),隻能(né但男ng)驅動熒光蛋白的弱表達。有的啓動子(如CMV)可以在多音體外細胞培養中很好(hǎo)地起坐舊(qǐ)作用,但有時(shí)在體内習短會(huì)沉默。當表達熒光蛋白時(shí),您應該盡可能(近機néng)嘗試使用一個強的廣泛性啓動子(如EF1A或CAG)。如果您必師光須使用組織特異性啓動子,請盡可能(雪些néng)選擇一個表達能(néng)力強的;如果您購行必須使用弱或很弱的啓動子,請爲熒光蛋白信号不足的可能(né票錯ng)性做好(hǎo)準備。當這(zhè)種(zhǒng)情況發(fā)生讀暗時(shí),這(zhè)并不意味著(zhe)您的熒光蛋白沒(méi)有表達,要公它可能(néng)隻是表達量不高。您可以使用更靈敏的檢測方法,如RT-雜校PCR或免疫熒光進(jìn)行檢測。

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在慢病毒和MMLV載體中表達熒光蛋白和黑

對(duì)于逆轉錄病毒載體系統(慢病毒或者MMLV),計房聚腺苷酸化信号(poly A)不能(néng)存在于LTR之間又銀,因爲這(zhè)會(huì)抑制病毒的包裝。林路多聚腺苷酸化信号存在于3'LTR中,來自上遊啓動子的轉議多錄會(huì)經(jīng)過(guò)上遊影學ORF的末尾繼續往下遊的啓動子和OR說城F轉錄,這(zhè)會(huì)導緻下遊ORF的線訊表達部分受到抑制。當下遊ORF爲熒光蛋近行白時(shí),其表達會(huì長服)大大減少。您可以采取如下措施提高熒光蛋白的表達:

  • 使用不同的載體系統,比如使用常規載體,腺病毒載體或腺相錯少關病毒載體

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  • 使用熒光更強的熒光蛋白變體(如TurboGFP代替靜和EGFP)

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  • 如果考慮在多順反子的上遊表達盒表達熒光蛋白,您可以使用說麗2A linker連接目的基因和熒光蛋白基因。體南然而,這(zhè)可能(néng)會(huì)影響多順反子中其他ORF的說內生物學(xué)功能(néng),也可能(néng)導緻熒光蛋白錯照表達較弱(見下文),且會(huì)增加載體構建的成(ché紙好ng)本和時(shí)間。

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在多順反子中表達熒光蛋白

當在多順反子中表達熒光蛋白基因時姐老(shí),通常會(huì)存睡個在以下所述問題,且有時(shí)就音熒光蛋白基因的表達與上遊下遊ORF有關。

  • 熒光蛋白基因在IRES的下遊

    在包含一個或多個IRES元件的多順反子中,與上遊ORF相比,下遊ORF表呢請達水平比較低(通常爲上遊的10%-20費拍%)。如果一個熒光蛋白在IRES金分的下遊表達,則熒光會(huì)較弱。如果您必須在多順反子的下遊表達熒光蛋煙睡白,您可以考慮使用2A肽(如P2A或T2A),而不是IRES。通過樂又(guò)使用2A肽,多順反子下遊ORF通常與上遊ORF的表達錢是量相當(或稍微低一點)。然而,2A肽也有缺陷,低兒如可能(néng)會(huì)影響靶基因(GOI)的功能(néng)。當我黃存在多個2A肽時(shí),下遊ORF傾向(錯女xiàng)于以較低水平表達。另外,2A肽的自我切割并不是100%有效的,其效工鐵率會(huì)受上下遊ORF序列的影響。因此,不能(néng)市書進(jìn)行有效自我切割的融合蛋白將(jiāng)會(huì)是一種(空下zhǒng)翻譯産物,在某些實驗運用中,這(zhè)是的還一個值得注意的問題。需要特别注意的是2A肽的切割會(huì技的)在上遊蛋白的C末端留下額外的短肽,并在下遊蛋白的N末端留下額外的脯妹地氨酸。在大多數實驗應用中,這(zhè)種(zh對朋ǒng)情況不會(huì)産生不良影響,一就但是在某些情況下可能(néng)會(huì)歌劇影響蛋白功能(néng)。

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  • 熒光蛋白是融合蛋白的一部分

    融合蛋白幾乎總是表現出比未融合蛋白較弱的熒光(比如EGFP/Neo融合蛋白的熒章電光比單獨的EGFP熒光更弱)。此外,未經(jīng)測相服試的融合蛋白可能(néng)存在胞内不穩定,錯誤折疊或無功能(néng)等問題錯白。如果您懷疑這(zhè)些是熒光弱的原因,可以嘗試以下操作:

    • 使用更強的啓動子(例如EF1A)來驅動林老融合基因的表達

     唱又;         &nb放兵sp;    作公;   了解更多啓動子信息

    • 以非融合形式表達熒光蛋白

    • 使用更亮的熒光蛋白變體(如TurboGFP代替EGFP)

        &nbs笑快p;           &國吧nbsp; 了解更多熒光蛋白信息

    • 增加一個linker,或者使用不同的linker來連接熒光蛋自我白和目的基因

    &nb視從sp;       &術報nbsp;   &nb火志sp;     了解更多連接子(linkers)信息

    • 調換熒光蛋白和目的基因的位置

熒光蛋白本身亮度低

一些熒光蛋白本身比同一顔色家族的其它種(zhǒng)類熒光更暗。例如在藍色窗放家族中,EBFP的亮度僅爲TagBFP亮度的三分之一。我們建議您根據我們的熒光跳習報告基因指南選擇一個更亮的熒光蛋白變體。

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