如何計算gRNA特異性分值?

我們使用的gRNA設計和評分使用了 CRISPR文庫設計(CLD)中的規則。簡而言之,對(duì)于每個物種(zhǒng行門),我們找出符合N(20)NGG規則的靶序列,把錯配堿基≤3的序列列爲潛在的脫靶位點,計算出每暗風個gRNA的脫靶分值,進(jìn)鐘睡而得出最終的gRNA特異性分值。gRNA特異性分值在0-100之間,分值越大話討靶向(xiàng)特異性越高。

請注意特異性分值隻是一個參考值。實際的靶向(xiàng)效率和一他特異性可能(néng)會(huì)與預測的分值有偏差,低分值的gRNA也可能(河紙néng)有較好(hǎo)的靶向(xiàng)效果。